（一）所有入庫保健食品都必須進行外觀質量檢查，核實產品的包裝、標簽和說明書與批準的內容相符后，方準入庫。
（二）倉庫保管員應根據保健食品的儲存要求，合理儲存保健食品，需冷藏的保健食品儲存于冷庫（溫度2-10℃），需陰涼、涼暗儲存的儲存于陰涼庫（避光、溫度不高于20℃），可常溫儲存的儲存于常溫庫（溫度0-30℃），各庫房的相對濕度應保持在45-75%之間。
（三）保健食品應離地、隔墻放置，各堆垛間應留有一定的距離。搬運和堆垛應嚴格遵守保健食品外包裝圖示標志的要求規范操作，堆放保健食品必須牢固、整齊、不得倒置。對包裝易變形或較重的保健食品，應適當控制堆放高度，并根據情況定期檢查、翻垛。
（四）應保持庫區、貨架和出庫保健食品的清潔衛生，定期進行清掃，做好防火、防潮、放熱、防毒、防蟲、防鼠和防污染等工作。
（五）應定期檢查保健食品的儲存條件，做好倉庫的防曬、溫濕度監測和管理。每日上下午各一次對庫房的溫濕度進行檢查和記錄，如溫濕度超出范圍，應及時采取調控措施。

（六）應根據庫存保健食品的流轉情況，定期檢查保健食品的質量情況，發現質量問題應立即在該保健食品存放處放置“暫停發貨”牌，并通知監管部門調查處理